jueves, septiembre 28, 2006
Año nuevo, oficina nueva
Hace un año, cuando comencé el doctorado, me pareció muy padre que tendría un cubículo, compartido, pero al fin un espacio para sentarme a trabajar. No soy vanidoso (eso digo yo), pero una de las cosas que se me hacían más chidas es que en la entrada del cubículo aparecía mi nombre 🙂
Pero de verdad lo mejor es la vista. El Instituto de Ciencias Cognitivas está en último piso (22) del edificio más alto en la universidad. Desde el cubo se tenía una excelente vista del canal Rideau y del lago de Dow.
El gusto no me duró nada, lo que pasó es que nunca me sentí a gusto en el cubo. Matthew y Sarra (mis compañeros de cubo) me caen muy bien, pero Matthew ocupaba (acaparaba) más del 80% del espacio con un sinnúmero de cosas inútiles, de manera que nunca me sentí con la libertad de instalarme. Llevé mis pocos libros y tenía cosas en mi escritorio, pero realmente prefería trabajar en casa, que para empezar no está nada mal porque así estoy más tiempo con Tere y Edgar Rodrigo, pero además me ahorra tiempo de transporte y pasar frío innecesariamente en invierno. Pero por el otro lado, me distraigo mucho y fomenta mi flojera.
Durante el verano redistribuyeron el espacio en el piso 22 porque se necesitaban oficinas para personal nuevo, además de que algunos espacios estaban bastante descuidados. De tal manera que mi cubículo fué asignado a algún profesor o investigador de otro instituto y a mi, y a la mayoría de los estudiantes nos reasignaron cubículo. Todos los que estamos en mi nuevo cubículo estabamos en otro o son estudiantes nuevos, de manera que vi en este cambio la oportunidad de ahora si, reclamar mi espacio y ponerme cómodo en la medida de lo posible.
No a todos nos tocó oficina con ventana, pero me dieron la oportunidad de elegir si quería ventana o no. La vista en mi nueva oficina es distinta, es menos espectacular, se ve parte del canal y la granja experimental, pero no me quejo. Cuando movieron mis cosas de oficina también movieron mi antiguo escritorio, de manera que cuando comencé a acomodar mis cosas (y me aseguré de ser el primero en hacerlo) me agradó mucho ver que mi antiguo escritorio era el más cercano a la ventana, así que no tuve que elegir escritorio. Creo que la distribución de los escritorios es incómoda y desaprovecha el espacio, pero parece que a nadie le importa más que a mí, así que a lo mejor después hago algo al respecto. Por lo pronto saqué mis cosas de las cajas y me instalé.
Parecía que la cosa iría un poco mal pues nunca dije que ese era mi escritorio y a una compañera de nuevo ingreso le pareció fácil comenzarlo a usar. Se me hacía feo decirle que ese era mi escritorio, sobre todo porque el que le dejamos a ella es el más feíto. Pero pues la tuve que ir desplazando antes de que ella me desplazara a mi. Para facilitar las cosas saqué del cubículo todo lo que le pudiera estorbar a ella en su escritorio: una computadora vieja que no sé porqué dejaron ahí, cajas vacías, etc. Parece que ella lo interpretó como que estaba limpiando mi escritorio, pero en eso abrió un cajón de mi escritorio y me dijo, mira aquí hay cosas, de quién serán? y le dije que son mías, ni modo, tenía que hacerlo. Pero además debía ser obvio para ella pues sobre el escritorio, y no solo en los cajones, había cosas mías desde antes que ella llegara. Finalmente, la semana pasada llevé la laptop para dejarla allá y me puse a trabajar en mi escritorio a pesar de que ella había puesto sus cosas encima de las mías. Ella había ido a comer, así que no tuve el menor empacho. Cuando vio que me había instalado ya no le quedó más que moverse al siguiente escritorio 🙂 Hoy terminé de llevar los libros que tenía en casa, así que espero ahora si no tener mayor problema para trabajar comodamente allá.
Después de demostrar que la lucha por espacio que causa conflictos es común en todos lados, los dejo con otras fotos que tomé la semana pasada desde el instituto.
lunes, septiembre 18, 2006
Tlahuilli de dos cabezas
Los lectores asiduos ya han de saber que tenemos una computadora portátil y una PC que se llama Tlahuilli. A Tlahuilli la armamos nosotros y cuando compramos las partes pensamos en que fueran más o menos actuales para que la máquina nos dure un buen tiempo sin muchas modificaciones. Además tenemos algunos proyectos para los que Tlahuilli nos va a ser muy útil, así que tenía que ser una máquina suficientemente potente. No es la gran cosa, pero tiene suficiente poder: disco duro de 200GB, 1Gb de RAM y procesador Atlhon 64.
Dado que para nuestros proyectos no sería víable usar windows, y además yo no quería usar windows de 32 bits teniendo procesador de 64 bits y como por principios nunca pagaría la licencia de windows, pues decidimos instalarle Linux. Para mis amigos no será novedad, todos saben muy bien que detesto windows y me encanta Linux. Sin embargo también tenía que pensar en Tere, que si bien ha tenido contacto con Linux y no le tiene aversión, tampoco ha tenido que hacer todo en Linux. Pero pues no había opción y Tere me apoyó, como en todo. Llevamos casi un año en el que sólo hemos usado el windows preinstalado en la laptop muy, pero muy ocasionalmente. Y pues la verdad no lo hemos extrañado, al cabo que desde hace como 2 años y medio ya no hemos podido jugar Empire Earth.
Los proyectos siguen estancados y a Tlahuilli le hemos tenido que hacer reparaciones y recientemente una extensión. Desde finales del año pasado estabamos pensando que me sería útil tener una computadora en la universidad, pero no estamos como para comprar otra y la laptop serviría muy bien para ese fin. Sin embargo la laptop en principio tiene 2 inconvenientes: uno es que no es muy práctico cargarla todos los días, y si la dejo en la universidad pues no podría trabajar también en casa, o por lo menos privaría a Tere de Tlahuilli mientras yo trabaje.
Eso se quedó pendiente pues había cosas más importantes que atender. En el verano tuve tiempo de investigar un poco mejor las opciones. La tarjeta de video de Tlahuilli tiene dos salidas de video que se pueden usar simultáneamente, sin embargo no es posible separar por completo la salida de 2 monitores en la misma tarjeta de video nvidia (según leí en las matrox si se puede). Lo que necesitaba era poder usar independientemente los monitores a través teclados y ratones independientes. Parece que hay formas muy rebuscadas de lograrlo como usar dos servidores gráficos sobre otro servidor que controle la tarjeta de video física (parchar Xephyr es un ejemplo). Esa solución no me gusta mucho porque tiene problemitas y me parece una solución poco elegante, aunque si ingeniosa y a fin de cuentas factible. Otra forma más rebuscada es usar un kernel de linux que te permita ejecutar sistemas linux virtuales e independientes. El problema con esa solución es que aísla completamente las 2 terminales, incluyendo el sistema de archivos, lo que significa duplicación de archivos para muchas cosas, vamos sería como tener 2 computadoras independientes, en el mismo hardware, y yo sólo quiero que dos personas puedan trabajar simultáneamente en una computadora. Userful es una solución comercial al parecer muy sencilla, pero pues no me late que sea comercial y no saber cómo meterle mano, además parece que aunque dicen que puedes usar el software gratuitamente si sólo lo usas para 2 pantallas no me queda claro que sea cierto pues dicen que cada media hora te aparecería un aviso de que no tienes licencia. La licencia cuesta 100 dólares que si bien es mucho más barato que otra computadora no me gusta nadita, pero además ni siquiera jala en Linux a 64 bits, así que lo descarté.
Después de dedicar mucho tiempo a buscar la mejor opción concluí que si se podría tener 2 pantallas, 2 teclados, 2 ratones y hasta 2 juegos de bocinas (no sé para qué, pero se puede) en Tlahuilli. Lo más probable era que necesitaríamos tener también 2 tarjetas de video, la solución con 2 tarjetas de video no es nada del otro mundo teniendo la última versión de Xorg y practicamente no tiene problemas, la pueden ver aquí.
Como en el peor escenario terminaríamos comprando otra computadora, compré únicamente el segundo juego de pantalla, teclado y ratón, y estuve jugando con la configuración de Xorg para ver si había manera sencilla de lograrlo nada más con una tarjeta de video. Encontré configuraciones interesantes para usar dos pantallas, pero no pude hacer lo que yo quería, es más no se puede. El problema es que no se le puede decir al servidor de gráficos que use la segunda pantalla para otra sesión. No me quise aventar el rollo de parchar Xephyr, además las tarjetas de video son muy baratas, sólo tenía que asegurarme que fuese nvidia para evitar conflictos usando drivers diferentes para cada tarjeta de video. Así pues, la semana pasada compramos una segunda tarjeta de video. Ayer la instalé y en un ratito ya tenía jalando los 2 escritorios. Tuve un problemita con el teclado USB en KDE (ya quedó pero aún tengo que ver porqué la tecla Up a veces no jala), todavía tengo problemitas con la aceleración gráfica en la nueva tarjeta de video (que es PCI), y al parecer el sistema está inestable y no he podido encontrar la causa, bien podría ser ajeno a la nueva configuración, en cualquier caso tiene solución.
Ahora ya puedo dejar la portátil en la universidad (con sus respectivas precauciones) y cuando necesite trabajar en casa no tengo que quitar a Tere (o a Edgar en un futuro) de la computadora. Ah! por si se lo preguntan, no, no está lenta.
Como podrán ver en las fotos, es posible incluso tener monitores diferentes, y en el futuro podríamos agregar otro juego de periféricos (y otro escritorio) para que podamos usarla los 3 simultáneamente. Otra ventaja sobre el tener una segunda computadora, además de que es mucho más barato, es el ahorro de tiempo y energía en administración y mantenimiento.
viernes, septiembre 15, 2006
hdparm
Todo comenzó cuando en el grupo de discusión creado para el curso de neuroimágen leí que hay versión para Linux de un software que vamos a utilizar. En la página del software leí un tip medio curioso que dice que el software hace uso extensivo del disco duro y que la instalación de Linux está pensada para hardware viejo, pero si tienes hardware reciente se puede mejorar el desempeño del disco duro por medio de unos simples cambios.
Yo ya había leído sobre hdparm, pero eso fué hace mucho. En ese entonces me parecía que encontrar los parámetros para tus discos duros sería una lata que no valía la pena, además de que las advertencias de que puedes dañar el sistema de archivos me impresionaban bastante. Como 6 o 7 años después con una larga historia de usar linux y apreciando su solidez ya no me dejo impresionar tan fácil por las advertencias, así que decidí que valía la pena probarlo.
Resultó muy sencillo! tan sólo leí está página y un poco del manual para optimizar el disco duro de mi laptop. Bueno, la primera vez me llevó un poco de tiempo, como siempre que haces algo por primera vez, y además tuve una dificultad. Ahora explico con más detalle.
Primero tenía que saber qué onda con el disco duro, ya tengo unos 3 o 4 años con mi laptop y pues no sé que tan viejo es el disco duro, además de que no sé nada de discos duros. hdparm -i /dispositivo y checar la configuración del bios es todo lo que se necesita para saber qué opciones utilizar con el disco duro. Descubrí que mi disco duro usa UDMA5 (no sé qué significa, pero entiendo que permite mayores velocidades de operación del disco), así que intenté activar esa opción en mi disco duro y no funcionó, no sólo no mejoró mucho la velocidad, sino que me marcaba un error. ¿qué podría ser? se me ocurrió que sería cosa del driver IDE, así que chequé con lspci qué chipset usa el IDE de la tarjeta madre y luego traté de averiguar qué driver tenía que ponerle al kernel. Efectivamente no tenía el driver adecuado en el kernel, después de recompilar el kernel pude activar sin problemas la optimización del disco usando udma5. La velocidad promedio de lectura del disco duro de la laptop mejoró de 3 MB por segundo a 20 MB por segundo. ¡Más de un 600%!
Intenté hacer lo mismo en la pc, tuve la misma dificultad con el driver del kernel, pero ya me sabía el caminito para resolverlo. Después de arreglar todo, la velocidad promedio de lectura del disco mejoró de 3 MB por segundo a 54 MB por segundo! más de 1500%!!!
Por supuesto no he tenido ningún problema con el sistema de archivos y si siento una mejoría en la velocidad del sistema, sobre todo al iniciar un programa, aunque no siento que la mejoría sea siquiera de un 100%, supongo que el incremento de velocidad es relativo al uso del disco duro y el medidor de uso del disco duro de gkrellm2 casi nunca muestra gran actividad. De cualquier manera es bueno saber que los discos duros se están aprovechando mejor, espero que eso resulte en una vida más larga de los discos.
Inicia un nuevo cuatrimestre
Este año lo comienzo con muy buen ánimo! El verano me cayó muy bien, no sólo por el emocionante viaje a Vancouver, sino porque la carga de trabajo fue definitivamente ridícula comparada con la de los cuatrimestres anteriores, tuve la oportunidad de descansar, pensar relajadamente acerca de todo este asunto de venir a Canadá, y sobre todo de disfrutar a mi familia.
Para evitar el exceso de trabajo, y las consecuentes innecesarias preocupaciones, decidí inscribir únicamente 2 cursos. Pero me siento tan bien, que de hecho me siento muy capaz de tomar un tercero y pues si, lo voy a inscribir. Para empezar estoy muy animado, pero también estoy muy tranquilo, no tengo encima todas las preocupaciones y dudas que tenía hace un año. Además mi comprensión del inglés hablado ha mejorado sorprendentemente, en clase ya no tengo ningún problema para entender todo lo que se dice, salvo con algunas excepciones, pero vamos ya no me quedo en babia. Además ya no necesito hacer un gran esfuerzo al concentrarme en entender lo que dicen, y eso es un gran avance. De hecho he notado que cuando me cuesta más trabajo entender es cuando me preguntan algo directamente a mí, yo creo que me entra el nervio de tener que hablar, pues aunque he mejorado bastante me sigue dando pena hablar.
Hace una semana iniciaron las clases en Carleton y ya tuve mi primera clase en cada curso inscrito (y no inscrito). Uno de los cursos que inscribí es obligatorio, aunque lo podría cursar después si fuese necesario, se trata del curso de «cognición y aspectos conceptuales», es decir, filosofía de la mente. El curso se ve bien, en la primera parte vamos a leer un libro que me está gustando. En la segunda parte cada quién va a presentar un tema de filosofía de la mente. El trabajo final es un ensayo sobre alguno de los temas vistos en clase analizando las conexiones e implicaciones para las ciencias cognitivas.
El segundo curso que inscribí era en teoría un curso básico de neurociencias, pero la primer clase resultó desconcertante, para empezar el salón donde nos citaron no existe, o al menos nadie lo encontró, lo único que encontramos fué una nota que decía los salones que correspondían a los cursos que en teoría se darían en el inexistente salón. Así que finalmente todos dimos con otro salón de clase que si existe. Este salón es muy pequeño para la cantidad de personas que habíamos, no tiene ventilación, y está en una zona ruidosa y polvosa a causa de remodelaciones en los alrededores. No fuímos los únicos desconcertados, hubieran visto la cara del profesor cuando finalmente encontró y entró al salón que si existe. Parecía que creía que se había equivocado de salón. Comenzó diciendo que eramos muchas personas y que no sabía qué iba a hacer. Habíamos 24 estudiantes de diferentes programas de estudios (unos de maestría, otros de licenciatura, unos de sicología, otros de neurociencias, incluso otros de la Universidad de Ottawa, y tres del doctorado en ciencias cognitivas). Además unos nos habíamos inscrito a un curso, y otros a otro curso. El maestro dejó claro que toda esa variedad era premeditada y a la vez el problema que no sabía cómo resolver. Sin embargo al final resolvió todo muy bien, creo que fué más su dramatismo que otra cosa. 6 estudiantes del doctorado en neurociencias tenían que darse de baja del curso, e inscribirse el próximo año, sin embargo tienen que asistir a todas las sesiones del coloquio de neurociencias durante 2 años para obtener su calificación. Así que rápidamente el grupo se quedó con 18 alumnos. En seguida aclaró con dedicatoria a los de ciencias cognitivas que el curso no es básico, así que si había personas que se inscribieron porque pensaban que iban a aprender lo básico, pues muy probablemente terminaran aprendiendo mucho más que lo básico pero con un esfuerzo indeterminable, por lo que recomendaba mejor otros cursos. Ya entonces procedió a explicar cómo funcionaría el curso y a repartir temas. Al parecer yo fuí el único que no tenía ningún conocimiento de neurociencias, y pues mejor dí de baja el curso. El maestro casi me convenció de quedarme, me comentó que realmente el curso no requiere que los estudiantes tengan conocimientos básicos de neurociencias pero que me costaría mucho trabajo, que terminaría entendiendo superficial pero suficientemente todo lo que se viera en el curso, que además nadie puede entender todo porque las neurociencias son muy extensas, y que todos los estudiantes de ciencias cognitivas han obtenido buenas calificaciones en años anteriores. Pero de verdad yo me inscribí a ese curso, a pesar de que no estoy obligado a tomarlo y de que dura un año, con la intención de aprender lo básico. Además hay otro curso de neuroimágenes que están ofreciendo por única vez, que no requiere que los estudiantes tengan conocimientos de neurociencias, y que me sería muy útil, al cual yo no me había querido inscribir precisamente porque prefería tener conocimientos básicos. Así que para mí ya no tenía mucha lógica tomar el curso (no) básico de un año y lo dí de baja. Ya había comprado el libro para el curso, pero no me arrepiento, planeo leerlo y quizás en el futuro sirva como material de consulta.
En su lugar me inscribí al curso de neuroimágenes que se ve muy bien, por lo menos el libro y el material del curso están muy interesantes y el curso tiene un componente práctico, lo cual está excelente porque no existen muchas opciones para aprender y practicar el analisis de las neuroimágenes. Lo ideal es trabajar durante algunos meses en un laboratorio de imagenología cerebral que desafortunadamente no tenemos en Carleton (los equipos son exorbitantemente caros), y aunque lo tuvieramos, sólo unos cuantos podrían trabajar ahí. Para este curso hay que escribir un ensayo en base a al menos 3 artículos recientes publicados en revistas de neurociencias, analizar un bonche de imágenes y al final presentar un poster sobre los resultados obtenidos al analizar las imágenes. Parece mucho trabajo, pero creo que está bastante decente comparado con todo lo que tuvimos que trabajar en el curso de Investigación Experimental en Cognición en el segundo cuatrimestre. El único defecto que le veo al curso es que el instructor es novato y hay que tenerle mucha paciencia, lo cual tampoco me parece grave.
El tercer curso es más bien algo diseñado por la profesora Kumiko Murasugi para mi. Ella fué mi profesora del curso de lenguaje y cognición en mi segundo cuatrimestre y durante el verano me puso a leer y a pensar con la intención de hacer investigación sobre juicios gramaticales (su área de investigación) en español. Al principio comenzamos a hacer eso como si fuera un curso de metodología en lingüística (tengo que hacer 3 cursos prácticos en diferentes metodologías como parte del doctorado). Pero al final del verano descubrí que también tengo que tomar un curso optativo de lingüística y los que se ofrecen este año no me llamaron la atención, así que platicando con ella optamos por continuar trabajando en ese proyecto pero que mi calificación sería más bien para cubrir mi requisito de lingüística, en lugar del requisito en metodología.
Eso es algo muy padre de Carleton, no sé si exista en otras universidades, pero aquí tienes la opción de inscribirte a un curso diseñado a tu medida. Obviamente no es sencillo hacerlo, tienes que cubrir ciertos requisitos y papeleo, pero es una opción que te da la libertad de trabajar con algún profesor en algún proyecto que te interesa y obtener una calificación.
Durante el verano leí bastante para trabajar en este proyecto y comencé a diseñar un experimento preliminar. Ayer nos reunímos para acordar como trabajaremos este cuatrimestre, qué tengo que hacer para obtener mi calificación, y para revisar cómo vamos y qué falta. Creo que vamos bien, ella me dijo que llevo realizado como el 30% del trabajo que ella espera que realice para obtener la calificación, así que sólo me falta el 70%, es decir, tengo todo el cuatrimestre para hacer un buen trabajo. Hasta ahora he leído un libro sobre experimentación en lingüística, un par de artículos clásicos sobre metodología y sobre juicios gramaticales, una parte de una tesis de doctorado sobre grados de gramaticalidad, así como literatura general sobre gramática del español. Sé que eso último les va a sonar chistoso, pero de verdad que uno nunca se pone a pensar sobre la gramática del idioma materno, y ahora que he tenido que hacerlo me doy cuenta de que no sé cómo explicar muchas cosas sobre el español. Para terminar este curso aún voy a leer más, tengo que solicitar autorización del comité de ética para llevar a cabo los experimentos, tengo que diseñar uno o dos experimentos, realizarlos, recopilar los datos, analizarlos y escribir un reporte, el cuál será mi trabajo final del curso. Ya tengo diseñado el primer experimento casi por completo, pero todavía tengo que leer y probablemente necesitaré un segundo experimento.
Además de los cursos tengo la intención leer y escribir para definir mi tema de investigación, necesito definir mi tema, mis supervisores y comenzar a buscar dónde realizaré mis cursos de metodología que pueden ser donde sea, el chiste es que sean en diferentes metodologías. Y tengo que hacer eso rápido porque después de este cuatrimestre ya sólo me faltará cursar una materia y los 3 cursos de metodología para concluír todos los cursos y dedicarme únicamente a mi investigación. Y como propósito de cuatrimestre nuevo quiero pasar más tiempo trabajando en la universidad porque hasta ahora he ido exclusivamente a mis clases, pero de eso platicaré en otra entrada.
Mi Doctorado en Ciencias Cognitivas 